تأسس متحف التاريخ الطبيعي في جامعة اليرموك عام 1981ـ ليقدم خدمات تعليمية وتثقيفية وترويحية لطلاب الجامعة ولجميع شرائح المجتمع المحلي من ناحية ولإجراء أبحاث ودراسات بيئية ميدانية تهدف لدراسة الحياة الفطرية وحماية التنوع الحيوي في الأردن بالتعاون مع الجهات ذات العلاقة وغيرها من الأهداف، ويتألف المتحف من ثلاثة أقسام رئيسة هي قسم الحيوان وقسم النبات وقسم الجيولوجيا، ويتبع المتحف كلية العلوم من الناحية الإدارية.
يعرض المتحف مقتنياته من العينات المحفوظة والمحنطة في القاعة الرئيسة وفي أكثر من مكان داخل الحرم الجامعي وخارجه مثل جامعة آل البيت ومركز الصفاوي ومطار الملكة علياء الدولي وبانوراما البحر الميت التابع لوزارة السياحة والمحطة البحرية في العقبة وذلك من أجل تعميم الفائدة على جميع أفراد المجتمع المحلي حيثما وجد ولتشجيع السياحة الداخلية والخارجية ومد جسور التعاون مع جميع المهتمين بالحياة الفطرية.
وتتعدد مهام وأنشطة متحف التاريخ الطبيعي الأردني لتشمل التوعية البيئية من خلال تقديم المحاضرات والندوات وكتابة المقالات وإصدار نشرة دورية وإقامة المعارض الدائمة والمؤقتة وغيرها.
ويقوم المتحف بنشر الكتب والمؤلفات المبسطة الموجهة الى عامة الناس وكذلك إجراء الأبحاث العلمية المتخصصة بهدف التوثيق ويتحقق ذلك من خلال إجراء الجولات الميدانية الدورية التي يقوم بها موظفو المتحف على مدار السنة.
يتطلع المتحف الى إنشاء مبنى مستقل وملائم يحتوي على قاعات عرض ومختبرات ليتمكن من عرض العينات بطريقة علمية وتثقيفية أفضل واجراء الأبحاث واستقبال الزوار وتقديم الخدمات المناسبة لهم.
هذا وقد شرع المتحف بتجهيز البنية التحتية لحوسبة مقتنيات المتحف على موقع الكتروني خاص به مرتبط مع الموقع الالكتروني للجامعة ليتسنى لأي شخص داخل وخارج الأردن الإطلاع على مقتنيات المتحف باستخدام الانترنت والوسائل الالكترونية الحديثة في البحث والدراسة.